De naam Gesualdo is niet alleen verbonden met zijn werk als componist maar ook met een misdaad die hij op 16 oktober 1590 heeft begaan. Carlo Gesualdo vermoordde zijn vrouw Maria d'Avaloz en haar minnaar Fabrizio Carafa nadat hij ze op heterdaad betrapte. Aangezien het een edelman niet paste zijn vrouw eigenhandig te vermoorden liet Carlo Gesualdo, prins van Verosa, zich bijstaan door enkele bedienden. Ze drongen de slaapkamer van prinses Maria Gesualdo d'Avaloz binnen, betrapten haar en haar minnaar volgens een oud verslag in flagrante delicto en losten enkele schoten, waarna Gesualdo de buik van zijn echtgenote met 53 messteken openreet.
De dood van Maria en haar geliefde Fabrizio Carafa, hertog van Andria, schokte niet alleen heel Napels maar drong door tot in alle uithoeken van Italië en was onderwerp van menige versregel. Gesualdo werd niet vervolgd omdat het om eerwraak ging. Maar hij werd wel heel zijn leven geplaagd door wroeging. Volgens de overlevering liet hij zich dagelijks door een dienaar geselen.