Het stadje Burkittsville, gekend vanwege de legende van de "Blair Witch", is uitgegroeid tot een soort bedevaartsoord en wordt druk bezocht in de hoop een glimp van de heks op te vangen. Dit werkt de nodige commercie in de hand uiteraard, en Jeffrey heeft dit dan ook goed begrepen. Hij runt een succesvolle website over deze legende en verkoopt allerlei prullaria en gadgets gaande van sweatshirts, tot zakjes aarde en zelfs kleine boomtakjes. Bezoekers van zijn site kunnen zich eveneens inschrijven voor een ontdekkingstocht doorheen de bossen waar de Blair Witch zou rondhangen. Een groepje van vier mensen laat zich door hem gidsen: het koppel Stephen en Tristine die beiden een thesis over het fenomeen schrijven, het vreemde meisje Kim die er een gothic levensstijl op na houdt en de film BWP best cool vond, en tenslotte Erica die ernaar uitkijkt om met de echte heks in contact te komen. De groep arriveert al gauw bij de ruïnes van het huis van Rustin Parr (de kindermoordenaar die reeds in BWP vermeld werd) en besluiten hier hun tenten op te stellen. Jeffrey installeert meteen zijn camera's om alle bovennatuurlijke activiteiten vast te leggen op band. 's Avonds bij het kampvuur vloeit de alcohol rijkelijk en wanneer ze 's morgens wakker worden blijken de meeste van hun spullen vernietigd. Niemand kan zich echter herinneren wat er precies gebeurd is. In een verlaten fabriek, waar Jeff woont, trachten ze alles op een rijtje te zetten en gaandeweg komt de waarheid aan het licht...
