1. Genesis of the Guyver: Guyver-eenheden worden gestolen van de enigmatische Chronos Organisatie in Japan. Guyver 1 wordt per ongeluk gevonden en geactiveerd door de scholier Sho Fukamachi.
2. Battle of the Guyvers: Vastberaden om de gestolen Guyver-eenheden te vinden, stuurt Chronos een agent om Sho te ontvoeren. Wanneer de agent tegen zijn wil in Guyver 2 wordt veranderd, heeft Sho geen keus behalve zelf weer de Guyver op te roepen.
3. Mysterious shadow: Sho's vriendin wordt ontvoerd om als lokaas te dienen in een wanhopige poging om de Guyver te vangen.