Foto
Inhoud blog
  • Einde
  • De laatste loodjes
  • thesis
  • Pasen
  • schimmels!
    Zoeken in blog

    Beoordeel dit blog
      Zeer goed
      Goed
      Voldoende
      Nog wat bijwerken
      Nog veel werk aan
     
    Jeroen - 3FBT
    Fantastische Bristol Trip
    02-04-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.schimmels!
    Hier ben ik alweer met een nieuwe blogupdate!
    Het is hier een gekke tijd geweest. Mijn mentor was meer dan een week naar Vietnam. Ondertussen is Myzone vertrokken naar een conferentie in Duitsland en morgen vertrekt Magda naar Polen. Colin is wel net terug van zijn trip naar Vietnam. 

    Vorige week was het een zot weekend met een helse Tomorrowlandgekte zaterdag 24 maart. De zondag ben ik naar Bath geweest, het is daar wel mooi en het is het meest toeristisch dat ik hier al gezien heb. Als je in de buurt bent moet je het wel eens zien, maar het is niet dat je er een hele dag gaat in rondlopen.

    Ik had vrijdag voor de eerste keer een transformatie gedaan naar schimmel, dus maandag zou ik de eerste indicaties hebben. Er was niet echt schimmelgroei te zien, dus nog een dagje afwachten. Ik nam een namiddag vrij want het weer was veel te mooi en ik was voor een onbekende reden doodmoe.

    Dinsdag was een extreem leerrijke voormiddag! Het was een group meeting van iedereen in onze onderzoeksgroep. Ik heb nieuwe mensen leren kennen en heb alweer bijgeleerd over waarmee ik eigenlijk bezig ben en wat er al aan vooraf gegaan is. Ook was ik verwonderd over wat er allemaal aan de gang is en welke onderzoeken parallel met elkaar verlopen, maar toch totaal over hetzelfde gaan. Zo zijn er nog verschillende mensen bezig met andere onderzoeken maar over dezelfde genencluster waar ik voor een stuk mee werk. Het is bijna niet te geloven dat die verschillende onderzoeken niet meerdere keren hetzelfde werk doen ofzo. Toch lijkt dit niet het geval te zijn. Een aardig staaltje management! In de namiddag ging de group meeting verder, maar het was zeer moeilijk en ik wist maar half over wat het ging en de onderwerpen waren ook niet zo interessant... Gelukkig werd het even onderbroken door een brandoefening (de tweede in evenveel weken). Na de group meeting kon ik niet laten om toch nog eens mijn culturen te bekijken. Nog steeds geen schimmels, maar wel bacteriekolonietjes... Dus, contaminatie... Dit is niet goed dus ik deed nieuwe voorbereidingen om het woensdag opnieuw te proberen

    Woensdag bleek mijn startcultuur gistcontaminatie had Surprised We weten niet hoe dit kwam, maar het zou niet mijn schuld zijn Smile
    Dus opnieuw voorbereidingen doen voor een nieuwe transformatie.

    Donderdag was er goede groei in de startcultuur en kon ik transformaties uitvoeren. We konden vele protoplasten verkrijgen dus waren de verwachtingen hoog. Ik kreeg ook de opdracht om nieuwe selectiefactoren te testen. Ik moest een concentratierange maken op 2 verschillende media, dus moest er veel medium worden aangemaakt.

    Vrijdag had ik dan redelijk wat werk om alle platen in orde te krijgen.

    Zaterdag wilde ik een stuk tekst schrijven voor mijn thesis. Ik verzamelde een ganse hoop informatie en ik heb ook veel gelezen en bijgeleerd. Ik ben er jammer genoeg niet toe gekomen om effectief een gans stuk te schrijven want mijn hoofd stond echt op ontploffen Surprised Ik had tijdens de week ergens mijn hoofd gestoten in mijn kamer, met een beetje bloed en een bult tot gevolg, dus ik denk dat het nog daardoor kwam dat mijn hoofd zo'n pijn deed. Ik ben dan maar naar buiten gegaan voor een wandeling en eindigde bij het vallen van de avond in Arno's vale en zag dat de poort naar het kerkhof nog openstond. Blijkbaar is het een vrij gekend kerkhof en het is ook zeer groot. Ik ging door de poort en wat ik vond was een zeer verouderd kerkhof met graven die overgroeid aan het raken zijn enzo. Het is een aparte plaats waar je waarschijnlijk verloren kunt lopen. Uiteindelijk werd het sneller donker dan ik verwacht had wat wel een speciaal effect had op een kerkhof.

    Zondag was ik vroeg wakker en werkte wat verder aan de thesis en vervolgens kon ik de ronde van Vlaanderen volgen via sportza streaming. De videokwaliteit was wel extreem slecht, maar ik kon alles volgen. Ik verhuisde ook eventjes met mijn laptop naar buiten. Met het gevolg: in het zonnetje genieten van de Belgische topdag in het wielrennen, en dat met een pintje in de had! Very Happy

    Vandaag had ik wel schimmelgroei na de transformatie, dus het is mogelijk dat de transformaties gelukt zijn. Ik heb iedere stam overgezet op een nieuwe plaat en nu moet ik opnieuw wachten totdat er groei is. Ik kan wel nog een nieuwe transformatie starten om meer getransformeerde stammen te krijgen en ik kan enkele transformaties doen van Magda omdat haar laatste mislukt zijn. Ik zal dit dus doen terwijl zij op reis gaat naar haar thuisland en hopelijk zijn er resultaten tegen de tijd dat ze terug is.

    Dit was het dan denk ik, ik zal waarschijnlijk deze week nog enkele fotootjes uploaden.
    Groetjes uit Bristol!

    02-04-2012 om 18:18 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    24-03-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.stage is...
    Stage is: supporteren vanuit het buitenland terwijl iemand anders alle moeite doet om voor jou een tomorrowland-ticket te bemachtigen...

    Bedankt voor alle moeite!!! Het heeft geloond, na 4u30 wachten hebben we een ticket kunnen bemachtigen... Very HappyVery HappyVery Happy

    En voor iedereen die probeerde een ticket te verkrijgen: proficiat, jullie hebben blijkbaar geholpen de grootste server van België te laten crashen.

    24-03-2012 om 00:00 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 5/5 - (1 Stemmen)
    21-03-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.Labo
    Hier ben ik nog een keertje!

    Het was een zeer rustig weekend, met niet zo'n mooi weer en ik was ook in een luie bui, dus er is niet echt iets gebeurd: was is blijven liggen, afwas is maar half gedaan en kamer is niet volledig opgeruimd (wat ik aanvankelijk wel van plan was).

    Maandag was een zeer leerrijke dag! Er was posternamiddag van het volledige onderzoeksdeel van de UoB. Dit resulteerde in een tentoonstelling met ongeveer 125 posters en uitleg van de meeste personen bij hun poster. Ik leerde heel wat bij en heb een aantal mooie posters gezien.
    Grappig detail: ik kwam bij een poster, las de titel en dacht WOW dat is interessant, ik lees verder (de namen van onderzoekers). "Aaaahhh tis een vn ons labo..."
    Ook heb ik weer wat weetjes bijgeleerd. Zo van die nutteloze dingen dat ik weer nooit zal vergeten... Wink
    Maandag heb ik ook opnieuw zo'n 1000 pipettips moeten klaarmaken, aangezien mijn voorraad alweer bijna op was...

    Dinsdag was het een rustige dag, ik moet de laatste plasmide afwerken voordat ik verder kan met mijn onderzoek, maar deze is ondertussen niet meer veranderd sinds 6 maart... De laatste stap blijkt niet te lukken en ik ben ondertussen bezig met een derde methode. Als dit niet lukt heb weet ik niet wat er verder moet gebeuren, want ik heb maar weet van 3 methoden om dit te doen... Waarschijnlijk zal ik dan moeten opnieuw een van die 3 methoden moeten proberen, eventueel met wat kleine aanpassingen. 
    Omdat het dus het laatste is dat moet afgewerkt worden voordat ik verder kan, is er heel wat tijd in het labo waarbij je niet veel kan doen... De reacties moeten telkens heel wat incuberen. Daarom ben ik maar gestart met het maken van materiaal en methoden voor mij thesis. Ik deed dit in het labo, op mijn laptop. Colin komt binnen en zegt: 'eigenlijk mag je niet met je laptop in het labo', en een beetje spottend zei hij erbij 'hij zou kunnen gecontamineerd raken.' Ik neem natuurlijk direct mijn laptop om hem uit het labo te halen, maar zegt hij 'niet achter kijken...' Dus laptop in het labo! Smile

    Vandaag is het wat drukker omdat ik moet controle doen van de reactie van gisteren, maar voorlopig zijn de resultaten niet veelbelovend...

    Dit was het dan alweer, tot nog een keertje!

    21-03-2012 om 17:01 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    15-03-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.Werklunch :D
    Dag iedereen!

    Dit weekend was het fantastisch weer!!! Zaterdag ben ik dan ook gaan fietsen, een heel eind naar Tyntesfield, een prachtige mansion van oude tijden met een schitterende tuin en wat bijgebouwtjes enzo. Het was zeer mooi, maar niet aan te raden om met een fiets te doen, ga daar naartoe met auto of bus, het zal waarschijnlijk beter zijn. Toen begon het wat bewolkt te worden dus ben ik maar snel teruggegaan naar Bristol. Dit was een echt leuke terugrit, want ik kon meerdere mijlen aan een stuk gewoon zeer snel rijden zonder te moeten duwen Laughing. Toen ik terug in Bristol was, was het nog zonnig weer, dus heb ik nog wat rondgehangen in het centrum. 

    Zondag had ik wat werk te doen, dus heb ik niet echt kunnen genieten van het lenteweer... 's avonds ben ik iets gaan drinken met Tom, een van de 2 studenten waarmee ik in contact kwam vorige week. Het was leuk! Hij moest wel vroeg uit zijn bed, dus was ik vroeg terug op kot, maar we gaan waarschijnlijk een groter feestje doen dit weekend.

    Deze week op het werk nog steeds heel wat problemen met de primers. Op het einde van een van de genen is eGFP aangebracht (in de chemie-afdeling) om expressie te kunnen aantonen door fluorescentie, voor een van de templates was er een extra site voor een van de primers waardoor de negatieve controle positief was. Die primer kon dus niet worden gebruikt. Vervolgens hebben een aantal verschillende primers getest, maar deze waren steeds negatief. Dit is zeer ongebruikelijk omdat eGFP is vrij klein en de primers in andere projecten wel werken. Na nog enkele testen konden we besluiten dat de template vanuit de chemie-afdeling geen eGFP bevatte... Dit is dus het nadeel wanneer je alles zelf maakt en geen templates koopt, soms is het gewoon mis...
    We zijn wel blij dat we nu het probleem gevonden hebben, maar ondertussen is er al een nieuw probleem opgedoken: na al onze modificaties aan een van de plasmiden schijnt de gateway-cassette niet meer te werken. Gelukkig is dit gemakkelijk op te lossen omdat we een plasmide hebben die voldoende gelijke stukken heeft dus kunnen we recombinatie in gist gebruiken.
    Jammer genoeg zijn we door deze probleempjes wel een heel wat minder ver gevorderd dan gepland. De Thaise vrouw was hier namelijk om het systeem te leren kennen van gen tot gebruiksklare plasmide en expressie in Aspergillus. Ze vertrekt morgen en we hebben zelfs nog geen transformatie kunnen doen naar Aspergillus.

    Deze middag zijn we gaan eten met het werk, het was een turks restaurant, het eten was zeer lekker! Ik durf zelfs te zeggen het beste eten dat ik hier al gegeten heb Surprised De sfeer was er helemaal in, en niemand moest zich haasten om terug te gaan werken. Wij hadden slechts een gateway die aan het incuberen was, dus daar staat niet echt een maximum tijd op, en Myzone was bezig met extractie, dus dat kon ook wel wachten... Maar aan alle leuke dingen komt een eind, en ondertussen zijn we alweer druk in de weer met ons onderzoek!

    Omdat deze blog alle aspecten van een buitenlandse stage moet aanhalen:  het weer is verschoven van 'heerlijk lenteweer' naar 'ip zn Belgisch'. Mijn fietspedaal maakte een ongeloofelijk irritant lawaai, dus heb ik wat kruipolie moeten kopen. Een van mijn lichten heeft het begeven, dus was ik gisteren in de pauze in het labo aan mijn fiets aan het prutsen Cool Ik heb ook al enkele keren een wasmachiene moeten vullen en de was uithangen, mijn kleren zijn niet veranderd van kleur en niet gekrompen, dus ik denk dat ik het wel niet slecht doe... Strijken is nog niet aan de orde geweest, mijn T-shirts enzo zijn voldoende als ik ze eens goed uitschud voordat ik ze uithang en eens gladstrijk erna, want ze moeten toch in mijn boekentas zitten en zijn altijd wel een beetje gekreukt, ik draag zoveel mogelijk de broek die niet echt kreukt, de andere liggen klaar om "dan wel eens" te strijken. Verder is het moeilijk om tijd/goesting te vinden om degelijk eten te maken, dus eet ik vooral stuff die in de oven kan klaargemaakt worden.

    En zoals gewoonlijk om af te sluiten enkele foto's:


    Deze foto is genomen in Ashton Court, een gigantisch park vlakbij Bristol. Om hier te komen is het gemakkelijkst om langs de hangbrug te gaan en door te rijden tot in het park :p Hier zijn blijkbaar herten maar ik heb deze niet gezien. Verder is er een golfterrein dat vrij toegankelijk is. Er zijn ook fietspaden, moutenbikeweggetjes, en een tour voor met paarden te lopen. Er zijn ook enkele voetbalvelden en dergelijke. Op het eind van het park is een open mijn waar men steen uithaalt. Hier wordt ook iedere zomer een luchtbalonfestival gehouden!

    Dit is nogmaals de hangbrug. Nu een foto van aan het water. Merk op dat het water zo laag staat, dit is deels te danken aan het droge weer hier, maar vooral omdat eb en vloed zichtbaar zijn in de rivier. Dit is namelijk vrij dicht bij de zee en blijkbaar ongeveer op zeeniveau.

    Dit is het gebouw van de City Council.


    Enkele seinen van school ^^

    Mijn collega's :D Deze foto is gemaakt aan het begin van de 'starter' van onze 2-gangenlunch. Op de voorgrond zie je mij, naast mij zit Andy, een van de voornaamste mensen in de onderzoeken hier. Hij werkt in het labo 2 verdiepen boven ons, dus we hebben er niet veel mee te maken, maar het gebruik van veel van onze methoden/materialen zijn mede aan hem te danken. Naast hem zit Colin, mijn mentor hier. Voor mij zit mijn poolse collega Magda, naast haar Nikul, de persoon waar ik altijd mee samenwerk, ze vertrekt morgen terug naar Thailand... Naast Nikul zit Myzone, de collega uit Maleisië.

    En als laatste Park street... Hier is er altijd volk, altijd auto's, en het is een steile helling. Ook zijn er hier veel winkels, waardoor er ook bijna altijd vrachtwagens aan het laden of lossen zijn... Dit is ook de verbindingsweg tussen de plaats waar de meeste café's zijn en de unief.

    Dit was het dan voor vandaag, tot de volgende keer!!
    Grtz

    15-03-2012 om 00:00 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    09-03-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.eerste keer uitgaan in Bristol...
    Heyla!
    Hier ben ik nog eens! Very Happy Het was een zeer drukke week op het werk, dus ik ben wat achter met het een en het ander... Het weer hier was nogal wisselvallig. Zondag bijvoorbeeld regende het vroeg in de ochtend, in de namiddag was er geen wolkje te bespeuren en tegen de avond werd het bewolkt. Woensdagochtend was het hard aan het regenen, waardoor ik op mijn werk toekwam als een doorweekte soepkip ofzo. Tegen ik terug naar huis moest fietsen was er alweer bijna geen wolkje te vinden...

    Zaterdag ben ik naar een nachtclub/dancing geweest, wat een marginale bedoening was dat Shocked amai, nog nooit meegemaakt!! Het was een heel nieuwe ervaring maar ik heb het niet zo heel lang volgehouden daar, want de ene zaal was wel geen slechte muziek, maar het stonk en de overgangen tussen 2 liedjes waren ronduit beschamend... De andere zaal was DISCO, klonk zeer interessant, maar, er was blijkbaar net een verkleedpartij aan de gang, waardoor een grappige mix ontstond, maar waar ik totaal niet in thuishoorde... De muziek was disco, de DJ deed zijn overgangen beter. De bar was wel een ramp, ondanks het beperkte aantal wachtenden moest ik een kwartier wachten om een drankje te krijgen... Ik heb al betere avonden uit gehad... Maar ik heb de dancing verlaten en nog wat rondgelopen... Ik weet ondertussen veel plaatsen zijn en heb ook meer stripclubs gevonden dan op de nightlife site te vinden zijn, maar ik heb nog gene getest (ondanks het gratis toeganspasje dat ik kreeg). Ik was vroeger thuis dan normaal in België het geval is, en heb nog een filmke bekeken. Smile

    Zondag was er diner bij mijn mentor hier, samen met iedereen van ons labo. Het was zeer leuk en we hebben veel gelachen, gedronken, bijgepraat en elkaar wat beter leren kennen. Het was een zeer multiculturele avond, want, zoals eerder vermeld, werk ik tijdelijk met een Thaise en werkt er hier een Poolse dame, een Maleisische dame en is de vrouw van Colin afkomstig uit Zwitserland. Het gerecht dat daaruit volgde was ook multicultureel, met exotische aperitiefversnaperingen, een engels voorgerecht, een soep dat ik nog nooit van gehoord heb, een Zwitsers hoofdgerecht en een 'triotje van desserts': engelse chocolademousse (trekt totaal niet op wat we in België gewoon zijn...), een Poolse taart (NJAMMIE) en een soort Thaise banan-something-dessert (ook niet slecht). Daar hoorde ik ook dat ik gewoon op een (heel erg) verkeerde plaats was uitgegaan...

    Over het werk deze week valt zeer veel te vertellen, maar eigenlijk ook zeer weinig. Maandag/dinsdag hadden we resultaten van E coli-transformatie waarmee we al meer dan een week bezig zijn, en de resultaten waren zeer goed. Woensdag dan gaven diezelfde stammen zeer weinig plasmide DNA en moesten we de oorzaak zoeken. Na heel wat overleg, onderzoek en een paar mislukte pogingen besloten we uiteindelijk om een hertransformatie in E coli uit te voeren. Dit bleek vandaag een succesvolle methode te zijn. Ook hadden we 2 gelijkaardige genen, maar we wisten niet welkeen in welk epje zat. Dus moesten we deze proberen te onderscheiden. Daarnet is het eindelijk gelukt, na ergens 5 digests en 3PCR's... Gruwelijke genen die 2... 

    Vorige week dan had ik een lekke band en ging ik hier naar een fietswinkel om deze te herstellen. De band werd hersteld terwijl ik mijn stage verderzette. Ik kreeg de fiets terug voor een 15pond Shocked, maar gisteren bleek mijn achterwiel niet goed vastgemaakt te zijn... Levensgevaarlijk fietsen als je het mij vraagt... Ik ging nogal boos terug en ze herstelden hun fout zeer zorgvuldig en met een vrij beschaamde uitdrukking.

    Donderdag over de middag heb ik 2 studenten ontmoet (via Colin), we zijn samen iets gaan drinken. Op het eerste zicht zijn het 2 coole gasten en we gaan waarschijnlijk zaterdagavond een stapje in de wereld zetten.

    Verder heb ik enkele weetjes: 
    De treinen in Engeland zijn schandalig duur. 
    Iedereen klaagt altijd over het weer, terwijl het er eigenlijk niet meer regent dan in bv België.
    Ook is er een algemeen idee dat het publiek transport op niets trekt, dus fiets ik overal naartoe :p
    Iedereen is hier weg van Belgische chocolade en bier.
    Inschrijvingsgeld is hier 9000pond voor volgend jaar. De studenten krijgen voor dat geld wel een hoop meer service dan de studenten bij ons.

    Ook enkele labo-weetjes
    Het copy number van een plasmide in E coli is enkel en alleen afhankelijk van de ori.
    Enzymen werken nog 6 jaar na de vervaldatum (indien ze op ijs blijven staan)
    Universiteiten in Engeland krijgen tussen 15 en 30% korting op producten van New England Biolabs.

    En tot slot nog enkele foto's

     
    Een van de 2 voornaamste hellingen dat ik iedere dag omhoog fiets... De totale helling is vergelijkbaar met de kemmelberg (het einde is iets minder steil).

    De campus security... Dat is ook niet echt iets dat we hebben in België denk ik, wel ng cool die auto's zo ^^

    Prachtig zicht op weg (via een omweg) naar de TESCO. De streek hier is echt schoon!

    De toren van het arts museum (again) met een prachtige lucht erachter! Ik vind dit een uitzonderlijk schone foto! tis lik e postkaartje ;)

    Het grootste casino hier. Ik passeerde er toen ik uitging zaterdag. Deze is 24/24 open, er is een parking in het gebouw aanwezig en naar het schijnt is het zeer modern aan de binnenkant.

    Dit was het dan voorlopig. Hopelijk vonden jullie het interessant! 
    Tot de volgende!!

    09-03-2012 om 00:00 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    29-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.eerste weekend in Bristol
    Hallo iedereen!
    Dit weekend heb ik wat rondgehangen in de streek, het was zeer mooi weer dit weekend! Zaterdag ben ik inkopen gaan doen en heb ik vervolgens wat door het park en de wijk waar ik verblijf gewandeld. Zondag heb ik een heel eind gaan fietsen (wat ik me ondertussen beklaag...). Ik ben tot aan de zee gereden, volgens google maps is dit langs de kortste weg iets meer dan 10mijl, en aangezien ik gewoon wat rondgereden heb was het zeker niet de korste weg... Waarschijnlijk 40-50 km gedaan, met vele heuveltjes enzo. Ik heb enkele foto's gemaakt, maar het zeegebied is gewoon vergane glorie van oude industrieparken en havengebied...
    Maandag kregen we de resultaten van de gisttransformatie van vorige week. Deze was goed gelukt en het was mogelijk om naar de volgende fase van ons onderzoek te gaan. Die fase is veel moeilijker en ingewikkelder, dus de kans op slagen ligt heel wat lager. Dinsdag hebben we dan de volgende genetische transformatie uitgevoerd. Dinsdag was een slechte dag met enkele fouten in het labo en ook enkele probleempjes. Hierdoor waren we maar iets na 7PM klaar met ons werk...

    De toren in het midden is waar een kunstmuseum zit van school. Dit is ook de plaats waar men rechten kan studeren denk ik. Iets links van de toren, en ietsje erachter werk ik. Het is net voor het hoge, bleke gebouw. Het hoge bleke gebouw links van de toren is het voornaamste gebouw van schooladministratie.

    Een eekhorentje dat ik tegenkwam in het midden van de stad, ergerns in een park.

    De vrij bekende Clifton Suspention bridge. De hangbrug over de rivier en een hoofdweg naar het havengebied. Ik reed zowel over als onder de brug zondag. De brug is gratis voor fietsers en voetgangers, gemotoriseerde voertuigen moeten een halve pond betalen.

    Vele groetjes uit Bristol! Het begint hier redelijk op te warmen en het weer is beter dan wanneer ik toekwam, lang leve de lente!


    29-02-2012 om 13:06 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    23-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.een beetje meer rond het werk
    Hallo beste mensjes!

    Hier nog eventjes met een update over het werk en met een foto van mijn Ucard :D
    Gisteren wat aan plasmiden geprutst en in gist gebracht, morgen resultaten analyseren (nu al eventjes gepiept op de platen en de eerste indicaties zijn positief!!!).
    Vandaag moeten wachten op pcr-primers, maar ik heb ondertussen een beetje leren werken met GENtle, een programma om plasmiden te bekijken en veranderen enzo.
    Vervolgens PCR uitgevoerd met de producten een gel gelopen ter controle (resultaten zien half en half), nu is een 2é PCR-run aan het lopen om te kijken als wij gemist waren of als er een probleem is bij het DNA-staal.

    Hier een foto van mijn Ucard. Het hangt vast aan een hanger voor rond mijn nek en ertussen zit een soort koord dat je kan uittrekken zodat je aan de ingang niet moet prutsen maar het gewoon uittrekken en voor de kaartlezer houden. Ik kon ook een kiezen voor aan mijn broek, maar rond mijn nek leek handiger.

    De man is mijn mentor (Colin Lazarus), de vrouw is de Thaise waarmee ik samenwerk (nikul). Hier is mijn mentor bezig met de 2é PCR in gang te zetten, zodat iemand anders hem in gang zette dan de eerste (uitvoering door andere persoon als controle op fouten gemaakt door personen).

    Een van de plasmiden waarmee we werken. Dit is het plasmide dat we hopen gemaakt te hebben in de gist die nu aan het groeien is.

    Het resultaat van de eerste PCR. De laan met alle bandjes is natuurlijk de ladder. Hier bestaat deze uit de standaard 100bp-ladder met daarbij lambda DNA die geknipt werd door HindIII. Het laantje ernaast is het tropAeGFP-gen (rood op de plasmide in foto hierboven). Dit gen is 720bp lang en werd met 60 verlengd door de primers en er is nog een klein stukje extra in de template die niet behoort tot het gen. De band ligt net onder de band vn 1kb. In het volgende laantje zit het tropB-gen maar deze zou ongeveer moeten 1,4kb zijn. Dit is duidelijk niet het geval, we hebben 2 bandjes, het tropC-gen zou moeten gemaakt zijn in het volgende laantje, maar daarvan is niets te zien. Deze zou moeten ongeveer 1kb lang zijn. De laatste id tropD, van ongeveer 1,5kb, dus dit is correct. De 2é PCR is ondertussen afgelopen, met ongeveer zelfde resultaat... morgen checken we de templates en de primers

    Dit was het voor vandaag, tot snel


    23-02-2012 om 19:03 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    22-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.aankomst/eerste werkdag

    Dag beste vriendjes en vriendinnetjes en andere coole mensn!

    Mijn aankomst hier verliep redelijk vlot, hoewel het stadsverkeer echt nog raar is, en mijn vader heeft nog bijna nooit in Engeland gereden, dus soms was het wel wat moeilijk. Rond 3PM kwam ik me aanmelden aan de receptie van het gebouw waar ik werk. Mijn begeleider hier heeft me wat uitleg gegeven en getoond waar alles is. Vervolgens gingen we naar de administratie om een enterence pass te halen. Ik zat in het systeem en de computer herkende mijn inschrijving en dat ik 20/02/’12 een pass moest krijgen, maar in het programma om die pass aan te maken was ik niet te vinden... ‘Never had this before, no idea what it is, I’ll send an e-mail to the IT department, come back tomorrow.’

    Ik ontmoette enkele mensen die hier werken, waaronder een jongedame uit Thailand, die hier een maand de biotechnologische technieken leert gebruiken. Ik zal de eerste maand vrij veel met haar samenwerken. Ik kreeg ook uitleg over hetgeen ik hier zal moeten doen. Vooreerst, om erin te graken, moet ik een onderzoek doen dat al lang gepland staat, maar waar niemand tot nu toe de tijd heeft voor gehad. De schimmelstam waarmee hier gewerkt wordt is zeer goed voor hun toepassingen, maar heeft een nadeel: deze produceert moeilijk en weinig sporen. Men heeft hier ooit deze schimmel genetisch aangepast zodat deze een stof produceerde dat ze nodig hadden, en toen merkte men dat de schimmel ook veel meer sporen maakte. Recentelijk is daarrond een artikel verschenen, waardoor het een ideaal moment is om daarop mijn onderzoek te richten.

    Vervolgens ben ik iets gaan eten met mijn ouders. En zijn we richting mijn verblijfplaats gegaan. Het is een klein huis waar een vrouw met haar twee zoontjes leeft. Er is een vrij grote kamer voor mij en ik heb toegang tot alle gemeenschappelijke ruimtes (zoals badkamer, living, keuken). Internet connection verliep zeer vlot, maar toegang tot het electriciteitsnet was heel wat moeilijker. Ik had twee adapters mee om de stopcontacten om te schakelen naar europese vormen, maar mijn ouders hadden een mee naar hun hotel en de andere bleek niet te werken... Ik vroeg een toolbox om eens te kijken wat het probleem was, maar de enige tools in het ganse huis was een veel te grote platte schroevendraaier en vier kruisers van verschillende maten. Gelukkig had ik spatels in alle vormen en maten en gebruikte ik deze als kleine platte schroevendraaiers... Er was inderdaad een draadje losgekomen en na heel wat prutswerk had ik dan toch elektriciteit.

    Hierna volgde een veel te korte nacht in een bed dat net niet lang genoeg is. Ik vertrok zeer vroeg met de fiets om de ruim 6km afstand tot mijn werk te overbruggen. Het ging zeer vlot, ondanks het drukke verkeer en het feit dat ik voor het eerst in Engeland fiets. Het raarste is dat fietsers ook gewoon op een rond punt rijden, zoals de auto’s en dat deze punten zodanig gemaakt worden dat je als fiets ook moet veranderen van rijstrook op een rond punt! Zeer gevaarlijk als je het mij vraagt... De tocht duurde net geen 20 min en was zeer lastig op het einde door een ongeloofelijk steile helling met in het begin drie verkeerslichten quasi direct na elkaar waardoor je telkens moet stoppen. Daarna is een rechte, steile helling met daarachter een bocht en een verradelijk steil stukje met verkeerslichten op het steilste moment.

    Eerste werkdag: 8u51, plaatselijke tijd: aankomst op mijn werk En er is hier niemand te bespeuren. Gelukkig kreeg ik gisteren al de code om binnen te graken in “the office”. Hopelijk krijg ik vandaag een pass om binnen te graken in het gebouw zodat ik niet steeds langs de receptie moet passeren, en een sleutel zodat ik toegang heb tot het labo.

    Mijn eigen labojas mag ik niet gebruiken omdat deze niet volledig gesloten is langs boven (GLP protocols I guess). Maar de grootste labojassen dat ze hier hebben zijn net te klein... Dus voorlopig toch mijn eigen jas. Ondertussen zijn hier al wat mensen toegekomen, alsook mijn begeleider, maar die vroeg om mij hier gewoon eventjes aan mijn persoonlijke bureau (ja ik heb mijn eigen deel in the office) te placeren... (letterlijk waren de woorden: just go there and play a bit) dus eventjes wachten... Tegen rond 11AM zijn alle security passes, internet passwords enz. in orde en kan ik beginnen aan mijn labowerk. Het eerste werk: een ganse berg doosjes met pipettips vullen en autoclaveren. Verder een kijknamiddag waarbij ik de gebruikte methodes van hier leer kennen. Ik heb al heel wat bijgeleerd, vooral inzake gels kleuren, wat hier 1000 keer beter werkt dan wat ik gewoon ben.

    Verder kreeg ik uitleg over het project van het Thaise meisje en deden we wat voorbereidend werk om gist te kweken en genetische modificatie uit te voeren. Om 5PM stopte mijn begeleider om een straat verder te gaan badmintonnen, we werkten wat dingen af en bleven nog eventjes babbelen. Vervolgens: Let’s call it a day, see you tomorrow!

    Hier nog enkele fotokes ^^

    Het eerste avondmaal

    Mijn eigen werkbank in het labo

     

    Mijn werktafel in gebruik bij de eerste job :p

    De minder nette werktafel van mijn begeleider hier. He calls it messy.

    Dit is het bureaudeel dat we gebruiken, er is nog een stuk aan de rechter kant, maar dit wordt niet door wetenschappers die bij ons werken gebruikt. De bureau in het midden met de laptopzak en de laptop voor de desktop is mijn bureau.

    Groetjes en tot snel!

    22-02-2012 om 00:00 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 5/5 - (1 Stemmen)
    19-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.Valiezenkoers
    Hallo iedereen
    De overgrote meerderheid van mijn materiaal is in de auto geraakt, er moeten nog wat kleinigheden ingepakt worden, maar we zijn er bijna klaar voor! De studiereis van afgelopen dagen was geslaagd ondanks enkele problemen en het feit dat het veel te snel voorbij was...
    Morgen om 7u vertrekken richting Calais, ETA @ Bristol: 2 PM. Vervolgens zal ik mijn begeleider van de Universiteit ontmoeten en van hem hopelijk wat uitleg en een rondleiding krijgen. Na het bezoek aan mijn werkplaats zal ik waarschijnlijk naar mijn kot gaan, uitladen en daana zien we wel... 
    Groetjes

    19-02-2012 om 18:42 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    14-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.dem pounds
    Klik op de afbeelding om de link te volgen Me haz dem pounds from bank ^^

    14-02-2012 om 14:38 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 5/5 - (2 Stemmen)
    13-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.maandagochtend, 1 week voor het vertrek
    Volgende week deze tijd ben ik ongeveer aangekomen in the UK, mijn valiezen moeten morgenavond ongeveer klaar zijn vanwege de studiereis...
    Het is niet simpel om te weten wat wel en niet meemoet als je 3 maand ergens anders verblijft....
    Ik heb wel het geluk dat mijn ouders mij kunnen voeren, dus ik heb ongeveer een ganse koffer plaats! :D Thank you parents!
    grz

    13-02-2012 om 10:31 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 0/5 - (0 Stemmen)
    04-02-2012
    Klik hier om een link te hebben waarmee u dit artikel later terug kunt lezen.Inleiding
    Dag mensjes!

    Vanaf nu kunnen jullie me volgen op deze blog. Dit zal gaan over mijn stage in Bristol.
    Waarschijnlijk zal ik dingen posten van alle delen uit de stage, het werk, het uitgaan, de cultuur van het land, de stad etc. Dit zal mij kennende op zeer onregelmatige momenten gebeuren, maar vrij frequent.

    groetjes
    Jeroen

    04-02-2012 om 00:00 geschreven door Jeroen  

    0 1 2 3 4 5 - Gemiddelde waardering: 3/5 - (2 Stemmen)

    Archief per week
  • 04/06-10/06 2012
  • 28/05-03/06 2012
  • 14/05-20/05 2012
  • 09/04-15/04 2012
  • 02/04-08/04 2012
  • 19/03-25/03 2012
  • 12/03-18/03 2012
  • 05/03-11/03 2012
  • 27/02-04/03 2012
  • 20/02-26/02 2012
  • 13/02-19/02 2012
  • 30/01-05/02 2012

    E-mail mij

    Druk op onderstaande knop om mij te e-mailen.


    Gastenboek

    Druk op onderstaande knop om een berichtje achter te laten in mijn gastenboek


    Blog als favoriet !


    Blog tegen de wet? Klik hier.
    Gratis blog op https://www.bloggen.be - Meer blogs