De serie speelt zich af in de fictieve Amerikaanse stad Neptune in de staat Californië ,ten noorden van San Diego. In het welstellende kustdorpje Neptune bepalen de rijden en machtigen het mooie weer.Zij drukken hun stempel op de gemeenschap en op de school neptune high en ze proberen hun minder fraaie geheimen zo geheim mogelijk te houden.Jammer genoeg voor hen is dat buiten de 18-jarige Veronica Mars gerekend. Zeis intelligent enkent geen vrees : 2 eigenschappen die haar goed van pas komen om als leerling-detective in haar vaders voetsporen te treden en de meest intrigerende dorpsgeheimen te ontrafelen. Overdag is ze een gewone tiener die hard moet studeren en af te rekenen krijgt met de gebruikelijke tienerperikelen.maar buiten de schooluren leeft ze voor haar passie: bijklussen als detective in het bureau van haar vader keith Mars,Speurend naar de waarheid in donkere steegjes,gewagend met fototoestel .
In een aflevering zijn er 2verhalen. Een gewoon onderzoek en het grote verhaal die een beetje voorkomt in allemaal
Hoe het verhaal begint
Veronica mars was ooit het liefje van Duncan kane,de zoon van softwaregigant Jake Kane, 1 van de rijkste families uit Neptune .Duncans zus lilly was haar beste vriendin.maar toen zij op mysterieuze wijze vermoord werd en Veronicas vader,sheriff keith mars,lilys vader als houfdverdachte aanduidde,veranderde Veronicas leven voorgoed.Haar moeder, die niet kon leven met het verlies van status,verliet onder mysterieuze omstandigheden haar gezin,Veronica en haar vader alleen achterlatend.Duncan dumpte haar zonder enige verklaring en de populaire Veronica werd door haar leeftijdsgenoten plots genegeerd en als een buitenbeetje beschouws.Ongeveer 2 maanden later word ze tijdens een feestje gedrogeerd en wakker zonder haar ondergoed,waaruit ze concludeerde dat ze was verkracht.Veronica's vader begon een privédetectivebureau na het verliezen van zijn baan als sheriff.Terwijl Veronica nog steeds een verklaring zoekt voor de gebeurtenissen uit het verleden en vastberadener is ooit de ware toedracht te achterhalen,klust ze bij als privé-detective in het kantoor van haar vader en neemt ze het op voor nieuwkomer Wallace die zich in Neptune al meteen de woede van enkele criminelen op de hals haalt
Het eerste seizoen draait om Veronicas missie om de echte moordenaar van Lilly te ontmaskeren. Al snel blijkt dat uit elk mysterie vele andere ontspringen. In de seizoensfinale worden deze en de andere mysteries die haar leven beheersten langzaam opgelost. De meeste afleveringen hebben het oplossen van Lillys moord als rode draad, maar bevatten ook andere mysteries waaronder die op Neptune High en de zaken van haar vader.
Aan het begin van het tweede seizoen is Veronica er in geslaagd weer een redelijk normaal leven op te bouwen. Maar er dienen zich nieuwe mysteries aan die ze onmogelijk onopgelost kan laten. Het tweede seizoen draait hoofdzakelijk om het mysterie dat een bus vol met Neptune High studenten over een klif rijdt aan het einde van een schooluitje. Een tweede mysterie draait om een moord waar haar aan-uit vriend, Logan Echolls van wordt beschuldigd.
In het derde seizoen gaat Veronica naar de universiteit. Afwijkend van de voorgaande seizoenen zal er geen doorlopend mysterie zijn maar drie afzonderlijke mysteries. Daarnaast heeft elke aflevering nog steeds zijn "mysterie van de week".