In 1934 werd het kasteel voor honderd jaar gehuurd door Reichsführer-SSHeinrich Himmler die het wilde ombouwen tot een Reichsführerschule SS voor de toekomstige SS-officieren. Hiermee zou het kasteel een Ordensburg worden. De Wewelsburg was ook het hoofdkwartier van de SS. Vanaf 1939 tot 1943 werd het meeste constructiewerk door dwangarbeiders uitgevoerd. Dit waren vaak politieke gevangenen en krijgsgevangenen. In de grote toren, de Nordturm, werd een marmeren mozaïek aangelegd van een Schwarze Sonne of Sonnenrad. Himmler gebruikte deze ruimte, de Obergruppenführersaal geheel volgens de gebruiken van de Ridders van de Ronde Tafel van Koning Arthur, dus met slechts twaalf gasten rondom zijn tafel, en Himmler zelf als dertiende. Dertien personen kan ook een parodie zijn op het Laatste Avondmaal of Himmler als de zwarte zon omringd door de tekens van de dierenriem. Deze ruimte werd het centrum voor belangrijke riten en bijeenkomsten. Twaalf leiders met de meeste verdiensten, gunstelingen van Himmler, zaten met hem aan een ronde zware eikenhouten tafel, met verguld hout in ruime varkenslederen stoelen met hoge ruggen, iedere stoel had een zilveren plaatje, met de naam van degene wiens vaste plaats het was, op de rugleuning. Naast ieder van hen stond een zilveren schaal waarin hun naam gegraveerd was. Onder de Nordturm, die verder uitgebouwd had moeten worden tot het Mittelpunkt der Welt, ligt de Gruft, een gewijde ruimte voor overleden SS-officieren. In het voorjaar van 1940 werd vlakbij het kasteel ook het concentratiekamp Niederhagen in gebruik genomen.
In 1945 gaf Himmler opdracht het kasteel op te blazen. Dit is deels gelukt: alleen de grote noordelijke toren is vernietigd. In 1973 is men begonnen met de restauratie van de Nordturm. In 1977 is besloten om het hele kasteel te restaureren om het als oorlogsmonument te behouden met museum en jeugdherberg.