Een oud gebouw, uit ongeveer 1900, wordt nu gebruikt als internaat. Er leven acht jongeren en Victor, degene die de baas van Het Huis Anubis is. Het programma volgt het leven van de jongeren en hoe die op hun eigen manier volwassen worden. Een ander iets dat natuurlijk ook centraal staat is het huis; Het Huis Anubis dat een geheim bewaart.
Rond 1930 reisde een jong archeologenechtpaar, Ewoud Winsbrugge-Hennegouwen en Julia Winsbrugge-Hennegouwen (de ouders van Sarah), naar Egypte. Ondanks alle waarschuwingen van de bevolking gingen ze de tombe van Toetanchamon binnen die in 1900 door Howard Carter ontdekt werd. Volgens de overleveringen nam het echtpaar Winsbrugge-Hennegouwen iets kostbaars mee uit het graf van de jonggestorven farao. Niemand weet of het uit wetenschappelijk oogpunt, uit hebberigheid, uit noodzaak is. Het echtpaar heeft het geheim van de verblijfplaats van de schat meegenomen in hun graf. Volgens Victor zijn haar ouders omgekomen door een tagiche ongeluk.
Cliffhangers
Seizoen 1
Aan het eind van seizoen 1 werd er een musical opgevoerd. Niemand wist dat de verdwenen Joyce vermomd in de zaal zat. Maar als Van Swieten er achter komt, moet Joyce vluchten. Ook wil Nienke de laatste wasrol beluisteren, die veilig opgeborgen zit in de kluis van Victor. Tijdens de musical glipt ze naar huis om de wasrol te beluisteren, maar dan komt Victor plots binnen. En dan verdwijnt Patricia opeens.
Seizoen 2
De Geheime club van de Oude Wilg weer eindelijk waar de graal verborgen is, maar zij worden op de voet gevolgd door Victor, Van Swieten en Zeno Terpstra. De club vindt de graal, maar zij moeten uitkijken voor Victor, want voor het vinden van de graal moest Corvuz opgeoffert worden, en daar is Victor niet blij mee. De club vlucht naar het schoolfeest, waar Fabian en Nienke voor het eerst zoenen. Maar wat is het geheim van de graal?