Tekst: Mike Carey, Ed Brubaker --- Tekeningen: Chris Bachalo, Billy Tan.
#313: De X-Men gaan het gevecht aan met Mister Sinister en zijn team Marauders. Tijdens het gevecht ontdekt Wolverine echter, dat de pasgeboren baby waar het allemaal om draait, in handen is van voormalig teamgenoot Cable. Als het Xavier Institute dan ook nog wordt aangevallen door een stel op hol geslagen Sentinels, is de chaos compleet. Cyclops staat voor een moeilijke keuze.
#314: Cable is op de vlucht met de eerste mutante baby in lange tijd. Achtervolgd door de Marauders en de Reavers is hij op weg naar Dallas, waar de mutante uitvinder de twee wellicht veilig naar de toekomst kan brengen. Daar wacht hem echter tegenstand uit onverwachte hoek. De X-Men, hun studenten en X-Force strijden samen om het voortbestaan van het ras.
Tekst: Mike Carey, Ed Brubaker --- Tekeningen: Humberto Ramos, Mike Choi, Marc Silvestri, Sheldon Mitchell, Billy Tan.
#311: Terwijl de X-Men genoeg aan hun hoofd hebben, worden ze verraden en overrompeld door de Marauders en vervolgens de Acolytes, de soldaten van Mister Sinister. Zij openen de jacht op mutanten die de toekomst kunnen zien en ze willen ook de voorspellende dagboeken van Destiny verzamelen. Het is aan Iceman en Cannonball, alleen zij kunnen nog iets ondernemen.
#312: Voor het eerst sinds lange tijd is een mutante baby geboren. Een team X-Men gaat naar de plek waar dit is gebeurd, maar ze zijn te laat: zowel de Purifiers als de Marauders waren daar al eerder en het stadje is in as gelegd. De helft van het team gaat op zoek naar de baby, terwijl Cyclops intussen de hulp inschakelt van enkele leden van het mutantenteam X-Factor.
Tekst: Mike Carey, Ed Brubaker --- Tekeningen: Mark Brooks, Scot Eaton, Salvador Larroca.
#309: Rogue en de X-Men kloppen aan bij SHIELD. Ze willen dat het hersenspoelen van Northstar en Aurora nu zo snel mogelijk ongedaan wordt gemaakt. Op dat moment vallen echter Exodus en zijn volgelingen aan. Exodus wil ontdekken of ergens ter wereld nog nieuwe mutanten worden geboren. Na de 'decimering' zijn weinig mutanten over en elk sterfgeval is automatisch een aderlating.
#310: Een groep Morlocks onder leiding van Masque is op zoek naar Magneto, omdat ze een reeks mysterieuze voorspellingen over mutanten volgen. Caliban kan ontkomen en klopt daarna aan bij Charles Xavier en zijn X-Men, die ook al naar Magneto op zoek zijn. Samen gaan ze op onderzoek en het komt tot een confrontatie tussen de doorgeslagen Morlocks en de X-Men.
Tekst: Mike Carey --- Tekeningen: Humberto Ramos, Chris Bachalo.
#307: Het team X-Men onder leiding van Rogue volgt een spoor dat moet leiden naar de mysterieuze Pan. Ze ontdekken dat Pan staat voor Pandemic, een wetenschapper die vroeger deels Rogue's krachten heeft overgenomen. De aanval wordt echter afgeslagen, het was al die tijd een val van Pandemic, die nu een nieuwe versie van zijn eigen virus wil testen op de gevangen Rogue. #308: De X-Men brengen hun met een virus geïnfecteerde leider Rogue naar de eilandstaat van Cable. Daar opent Lady Mastermind de jacht op een vreemde aanwezigheid in haar eigen geest. Deze zogenoemde Mummudrai waarschuwt voor de komst van de Hecatomb. Cable smelt met deze aanwezigheid samen, maar hun tegenstander is veel te sterk. Hun laatste hoop ligt bij Rogue.
Tekst: Ed Brubaker --- Tekeningen: Billy Tan, Clayton Henry.
#306: Een op wraak beluste Vulcan trouwt onder toeziend oog van de herrezen D'Ken met Deathbird. Tijdens die ceremonie openen de Starjammers samen met de X-Men de aanval, waarna Vulcan een greep naar de macht doet en zich tot keizer kroont. De X-Men moeten tot het uiterste gaan en intussen staat ook nog het leven van Charles Xavier, hun mentor, op het spel.