Naruto groeit op zonder ouders en is eigenlijk helemaal alleen. Omdat hij de ziel van de demon in zich meedraagt die 12 jaar geleden bijna het hele dorp heeft vernietigd, heeft iedereen een hekel aan Naruto en negeren ze hem. Naruto probeert er alles aan te doen zodat mensen maar kunnen zien dat hij ook bestaat. Hij wil graag erkent worden, als mens en Ninja. Maar Naruto heeft meer ambities. Hij wil namelijk de sterkste en beste ninja worden die er bestaat.
Naruto zit op een school waarin je wordt opgeleid tot Ninja. Als hij de eerste fase van zijn opleiding heeft afgerond wordt hij in een team van drie ninja s geplaatst om missies uit te voeren. Naruto komt in een team met Sakura,het meisje waarop hij al jaren verliefd is en de jongen Sasuke. Sasuke is een jongen waar alle meisjes verliefd op zijn, en hij is ook nog eens een hele sterke ninja. Dit kan Naruto niet uitstaan en hij heeft steeds het gevoel zich moeten te bewijzen ten opzichte van Sasuke
